1905-1908年
京师大学堂1905-1908年期间设立博物实习科培养动植物标本制作人才,现馆藏的秋沙鸭和石竹等标本就是那时采集的标本。
1924年
1924年中国植物分类学早期先行者钟观光先生历时4年赴全国11个省份采集15000多号植物标本后建立北京大学植物标本室。
1946年
1946年,清华大学植物标本室并入北京大学植物标本室。
1952年
1952年,燕京大学植物标本室并入北京大学植物标本室。
2003年
2003年,植物标本室、动物标本室、昆虫标本室合并成保管。
2018年
2018年,北京大学生物标本馆正式开馆